原产地网上签证系统支持代理企业与被代理企业在线建立授权关系后，代理企业以被代理企业的公司信息办理原产地证书。具体操作包括以下三步：

第一步，由代理企业向被代理企业发起代理授权申请。代理企业登录系统后，点击“企业信息管理”模块中“授权管理”按钮后，点击“新增授权”，系统将要求代理企业输入被代理企业的贸促会编码。

第二步，被代理企业审核申请后，双方代理关系成功建立。被代理企业登录原产地网上签证系统后，点击“企业信息管理”模块中“授权管理”按钮后，系统将展示授权管理列表。被代理企业找到页面中待确认的申请，点击此条代理信息右侧的“审核”按钮即进入审核详情页。在审核结果栏目选择“通过”，点击页面右上方的“提交”键，系统将显示《授权协议》弹窗。点击确认后，双方代理关系成功确认。

第三步，代理企业可以使用被代理企业身份申办原产地证书。代理企业使用本公司账号登录系统后，在页面右上角选择“切换企业”按钮，即可选择相应的被代理企业。切换至被代理企业身份后，即可进入原产地证书管理界面，使用被代理企业相关信息办理业务。

此外，双方中任意一方可停用代理关系。具体操作为：点击“企业信息管理”模块中“授权管理”按钮后，在授权管理列表中选择相应的合作方信息，在此条信息后方功能栏中选择“禁用”，双方代理关系终止。